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如何评价总RNA或mRNA的质量??

人阅读 发布时间:2019-07-24 16:15

一个细胞有很多种的RNA,如mRNA,rRNA,tRNA总RNA指的是一个细胞(一种生物)里面所有种类的RNA平时说的提取总RNA指的就是提取一个细胞里面的所有种类的RNA 。

mRNA的功能:把DNA模板链上的 碱基 序列 转录 为RNA分子上的碱基序列(mRNA),再从mRNA上的碱基序列通过合成蛋白质的机构获得 氨基酸 序列。

如何评价总RNA或mRNA的质量??

1. 相关概念 RNA质检参数OD260/OD280、OD260/OD230的意义。 260、280、320、230nm下的吸光度分别代表了核酸、蛋白质、盐浓度和有机溶剂的值。 A230: 测定其它碳源物质,如酚,糖类等。 A260:核酸的吸收峰测,测RNA,DNA,引物等的浓度用的。 A280:蛋白质的吸收峰。 一般的,我们只看OD260/OD280(Ratio,R)在1.8~2.1范围内时,我们认为 RNA中蛋白的污染是可以容忍的,不过要注意,当用 Tris 作为缓冲液检测吸光度时,R 值可能会大于 2(一般应该是 2.2时,说明RNA已经水解成单核酸了。纯RNA的OD260/OD280的比值为2.0。

2. RNA质量检验 RNA样品的品质检测一般分为总量,纯度与完整性三大项。 总量:微量分光光度计测260nm吸收值计算。 纯度:微量分光光度计测260nm/230nm吸收值的比值,用于评估有机溶剂残留;260nm/280nm吸收值的比值,用于评估蛋白质污染比例。 完整性:以Agilent Bioanalyzer进行毛细管电泳(capillary electrophoresis),并以软件的RIN(RNA Integrity Number)分数评估,10为RNA完整性zui好,0为zui差。 l RNA纯度 RNA在纯化过程中容易受到DNA、蛋白质及有机溶剂的影响,这些残存物将会影响以后的操作。光谱分析(NANODROP)利用物质对不同波长光的吸收度的不同,可以鉴别出溶液纯度及浓度。RNA溶液的A260/A280的比值是一种RNA纯度检测方法,比值范围一般为1.8-2.1。各项实验对RNA纯度要求不一,比如即使比值超出这个范围,RNA样品也一样可以用于一些普通实验中,如Northern杂交、RT-PCR、荧光定量PCR和RNA酶保护等实验。

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